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制藥業正面臨從傳統工藝向現代技術的轉型過程；醫藥流通領域也正面臨全面的改革沖擊，新的產業格局正在形成。醫藥行業產值增速遠遠高于其他行業平均水平。行業的急速發展急需提升整體管理水平，對信息化技術的應用要求也更加強烈。
　　醫藥行業產業鏈長，從化工原料到化學原料藥再到西藥成品，從中藥材到中成藥。考慮到最終消費者使用，整體產業鏈還包括批發、零售、醫療機構等多個環節。
　　醫藥行業按組成的企業又可劃分為：醫藥生產企業、醫藥保健品及消費品生產企業、醫療設備生產企業、醫藥商業企業、醫療機構、科研機構。其中，商業企業可進一步劃分為批發、零售兩種類型。而制藥企業又可細分為四大類：藥品（西藥/中藥/中成藥）、醫療器械、化學制劑和玻璃儀器。
　　醫藥行業企業數量眾多，目前國內流通領域有13萬家左右，批發1.3萬，零售11.5萬；生產企業約5000多家，生產的品種1萬多種，其中原料藥1400種，制劑藥4000種，植物藥8000種。和國外發達國家相比，我國制藥企業數量多，單個企業生產品種少；零售企業數量難以滿足我國人多地廣的現狀。從收入結構看，20％的大企業占據的收入比例為行業的30－40％左右，所以總體而言企業的規模還較小。
　　醫藥行業的運營效率低主要由于多個方面：雖然說醫藥行業是個高增長、高收益的行業，我國企業卻由于整體經營效率很低，導致行業虧損面高達30％以上；流動資金占用高，醫藥行業產成品、應收賬款占企業流動資金的30～40％ ，導致行業整體資本流動率低；銷售費用高，難以管理。